Triom: Combine & Merge Orders

同梱の作業が多いので、こちらを利用しました。色々みましたが、一番使いやすく、自動でも、手動でもいくつかの注文をまとめることができます。
送料もどの注文の送料を使用するか選べます。ただ同梱の場合、差額送料が追加になる場合があるので、確実に正確な送料の注文書を出せない場合もあります。でも、そのあたりはshopify側の課題になるかと思います。サポートもしっかりしています。